La sezione è composta dalle vetrine originali ottocentesche allestite e suddivise secondo l’assetto che Scarabelli diede loro nel 1874.
Vetrine 1-12 Rocce e fossili del versante adriatico dell’Appennino.
Vetrine 13-16 Rocce e fossili del versante tirrenico dell’Appennino, delle isole mediterranee e delle Alpi italiane.
Vetrina 17 Saggi di rocce e minerali di Russia.
Tutte le vetrine e i reperti evidenziati con il bollino arancione sono descritti nelle schede di questa guida multimediale.